De Helpermolen heeft een spannende geschiedenis. De eerste molen is op deze locatie geplaatst in 1879. De molen die toen verrees had eerder al op de vestingwerken aan de Kijk in ’t Jatstraat gestaan.
In 1896 werd deze molen door brand verwoest en kwam er een nieuwe stellingmolen. Ook deze kwam van elders; hij stond eerder in Niezijl. Molenmaker Noordewier brak hem daar af en bouwde hem in Helpman weer op.
De molen heeft tot 1918 op windkracht koren gepeld. Na dat jaar stapte de toenmalige molenaar, J. van der Molen, over op elektriciteit. Het bovenstel van de molen werd toen afgebroken. Dat gebeurde in die periode met meer molens; elektriciteit was natuurlijk een betrouwbare bron van energie en het afbreken van het bovenstel zorgde voor een flinke verlaging van de brandverzekeringspremie.
Sinds de Tweede Wereldoorlog heeft de molen verschillende bestemmingen gehad, variërend van woning tot schilders- en afbouwbedrijf.